Lúa ưu thế lai thông qua sàng lọc di truyền
Nguồn: Yanru Cui, Ruidong Li, Guangwei Li, Fan Zhang, Tiantian Zhu, Qifa Zhang, Jauhar Ali, Zhikang Li, Shizhong Xu. 2020. Hybrid breeding of rice via genomic selection. Plant Biotechnology Journal (2020) 18(1):57-67.
Cải tiến giống lúa lai trên cơ sở ưu thế lai F1 là chiến lược chọn giống không riêng cây lúa mà cả những loài cây trồng khác như bắp. Genomic hybrid breeding là một công nghệ sử dụng bộ chỉ thị phân tử có tên là whole-genome markers để dự đoán được ưu thế lai của con lai trong tương lai. Các tổ hợp ưu thế lai tối ưu theo dự đoán được mang ra đồng ruộng để khảo nghiệm và phóng thích giống mới sau kết quả khảo nghiệm chính quy. Điều này sẽ làm tăng cơ hội chọn lọc những hybrids thật sự ưu việt với giá thành tối thiểu. Người ta áp dụng thuật toán dự đoán genomic best linear unbiased prediction để hoàn thiện quy trình sàng lọc con lai trong một quần thể bao gồm 1495 tổ hợp lai F1 (hybrids). Giá trị 10-fold cross-validations mang tính chất lập lại cho thấy: khả năng dự đoán của 10 tính trạng nông học quan trọng biến thiên 0,35 - 0,92. Sử dụng 1495 hybrids này làm mẫu training, người ta dự đoán có 6 tính trạng nông học của 100 hybrids dẫn xuất từ các tổ hợp lai ‘half diallel’ với 21 bố mẹ. Con lai khác với bố mẹ trong quần thể mẫu training. Khả năng dự đoán tương đối cao, thay đổi từ 0,54 (năng suất) đến 0,92 (chiều dài hạt). Kết luận rằng: quần thể 1495 hybrids có thể được sử dụng để dự đoán dòng hybrids từ những bố mẹ chưa được biết về mối quan hệ. Người ta sử dụng quần thể training để dự đoán tất cả hybrids có tiềm năng thuộc bất dục đực tế bào chất từ 3000 giống lúa thông qua sàng lọc di truyền bằng 3K Rice Genome Project. Sử dụng chỉ số toán học breeding index kết hợp một lúc 10 tính trạng, người ta xác định được đỉnh và đáy của 200 hybrids dự đoán. Kiểu gen SNP của quần thể training và các thông số di truyền được ước đoán từ quần thể nàyđề sẵn sàng cho nội dung thực hiện tổng quát, cũng như minh chứng sâu hơn genomic hybrid theo dự đoán từ tập đoàn giống lúa đang nghiên cứu. Xem https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/31124256/
Không có nhận xét nào:
Đăng nhận xét