Di truyền tính chống chịu nóng của cây lúa thông qua “long non-coding RNAs”
Nguồn: Zhengfeng Zhang, Huahua Zhong, Bo Nan & Benze Xiao. 2022. Global identification and integrated analysis of heat-responsive long non-coding RNAs in contrasting rice cultivars. Theoretical and Applied Genetics; March 2022; Vol. 135: 833–852
Phân từ lncRNAs (long non-coding RNAs) có vai trò quan trọng giúp cây phản ứng lại với những thách thức ngoại cảnh. Hiểu biết tốt về sự điều tiết của gen bằng phương pháp lncRNAs và sự xác định có tính chất hệ thống của chúng sẽ cung cấp cho chúng ta những lợi ích vô cùng to lớn cho nông nghiệp hiện đại. Theo nghiên cứu này, người ta đã hoàn thiện được chạy kết quả trình tự DNA của strand-specific RNA đối với hai giống lúa, giống chịu nóng ZS97B và giống nhạy cảm với nhiệt độ nóng SYD2. Có tất cả 2743 phân tử lncRNAs giả định được người ta phân lập. Phổ biểu hiện gen khi phản ứng với nhiệt độ nóng cũng được thiết lập. Người ta xác định 231 phân tử DELs (differentially expressed lncRNAs) trong nghiệm thức stress nóng, bao gồm 31 DELs phổ thông trong cả hai giống lúa và 103 DELs chuyên biệt của giống ZS97B; 97 DELs chuyên biệt của giống SYD2. Tất cả đưpọc định nghĩa là phân tử heat-responsive lncRNAs (viết tắt HRLs). Các gen đích mang mật mã di truyền của HRLs đã được dự đoán, và GO cũng như KEGG đều được chú thích di truyền rõ ràng (annotated) của các gen đích HRL cho thấy chức năng trong các gen HRLs có thể được xem xét rõ ràng. Mạng lưới tương tác giữa HRLs, gen đích và phân tử relevant miRNAs được người ta thiết kế. Chính các HRLs và những targets của chúng được người ta so sánh với những QTLs đã nghiên cứu trước đây đối với tăng trưởng cây lúa giai đoạn mạ trong điều kiện có xử lý mặn. Mười HRLs và mười hai gen đích đã được liên kết với năm QTLs liên quan đến stress nhiệt độ nóng. Kết quả chạy trình tự DNA cho thấy có rất nhiều motifs phong phú hơn đáng kể trong chuỗi trình tự DNA của 231 HRL. Kết quả cung cấp cho người ta một nguồn vật liệu di truyền đáng giá để định tính xét về lâu dài phân tử lncRNAs liên quan đến stress nhiệt độ nóng và cải tiến tính trạng chống chịu nóng của cây lúa.
Không có nhận xét nào:
Đăng nhận xét