Phân tích GWAS và hệ transcriptome của gen OsCBP606 – mẫn nhiễm với bệnh đạo ôn thông qua calmodulin trong cây lúa
Nguồn: Zhikai Han, Wenyu Lu, Shengyi Chen, Qiwei Huang, Huabin Xie, Chengye Sun, Jiayang Li, Renhui Li, Xiaodi Zou, Wenjie Zhou, Danhong Wei, Chun Chen, Tao Guo, Jiafeng Wang. 2026. Genome-Wide Association and Transcriptome Analyses Identify OsCBP606 as a Calmodulin-Mediated Susceptibility Gene to Magnaporthe oryzae in Rice. Rice (N Y); 2026 Jan 9. doi: 10.1186/s12284-025-00873-6.
Bệnh đạo ôn lúa, do nấm Magnaporthe oryzae, là một trong những bệnh gây thiệt hại lớn nhất trên toàn thế giới. Xác định được những QTLs hoặc gen R mới điều khiến tính kháng bệnh này là vô cùng cấp thiết để phát triển giống lúa cao sản kháng bệnh bền vững. Theo nghiên cứu này, người ta tiến hành phân tích GWAS (genome-wide association study) để xác định QTLs gắn với tính kháng đạo ôn, cơ sở dữ liệu kiểu hình và kiểu gen được thu thập từ tập đoàn có 236 mẫu giống.
Có tất cả QTLs quan trọng liên kết với tính kháng bệnh đạo ôn được phân
lập trên nhiễm sắc thể 1, 5, 6, 7, 10, và 12. Bón QTLs chính (qMZ6.1, qMZ7.1, qMZ10.1, và qMZ12.1) là những contributors chủ chốt đến tính kháng bệnh. THống qua kết hợp phân tích gen biểu hiện DEG (differential expression genes) và chú thích di truyền các gen dự đoán trong khu vực qMZ12.1 trên cơ sở kết quả haplotype và kiểu hình đánh giá với bệnh, người ta xác định được OsCBP606, gen mã hóa protein có tên là “calmodulin”, đây là gen ứng cử viên trong vùng qMZ12.1. So sánh với cây lúa “wild-type”, cây bị knockout gen OsCBP606 biểu hiện tính kháng tăng, trong khi cây mang gen OsCBP606 biểu hiện mạnh thì tăng tính nhiễm bệnh. Kết quả nhấn mạnh được vai trò tích cực của OsCBP606 trong
điều tiết phản ứng miễn dịch cây lúa, một mục tiêu đầy tiềm năng cho
chương trình cải tiến giống lúa cao sản kháng bệnh đạo ôn.
Xem https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/41511654/
Hình: Phân tích GWAS tính trạng kháng bệnh đạo ôn của tập đoàn 236 mẫu giống lúa.
Không có nhận xét nào:
Đăng nhận xét