2021. Huỳnh Kỳ. Hệ phiên mã giống lúa Trà Lòng 2 dưới tác động của mặn giai đoạn cây con

 HỆ PHIÊN MÃ GIỐNG LÚA TRÀ LÒNG 2 DƯỚI TÁC ĐỘNG CỦA MẶN GIAI ĐOẠN CÂY CON

Huỳnh Kỳ, Văn Quốc Giang, Nguyễn Văn Mạnh, Trần In Đô, Nguyễn Thành Tâm, Chung Trương Quốc Khang, Nguyễn Châu Thanh Tùng, Nguyễn Lộc Hiền  

DOWNLOAD 

Tóm tắt

Trong nghiên cứu này giống Trà Lòng 2 đại diện cho kiểu gen chống chịu và Nếp Mỡ đại diện cho kiểu gen mẫn cảm stress mặn. Thí nghiệm được thực hiện ở giai đoạn 14 ngày sau nảy mầm, cây mạ được xử lý muối NaCl ở nồng độ 100 mM trong 12 giờ, mẫu sau khi xử lý stress mặn được thu thập, ly trích RNA và giải trình tự hệ gen biểu hiện bằng hệ thống Illumina Hiseq 2500. Kết quả phân tích hệ gen biểu hiện chuyên biệt cho giống Trà Lòng 2 (1732 gen) có số lượng gen biểu hiện nhiều hơn giống Nếp Mỡ (432 gen). Khi so sánh giữa 2 hệ gen biểu hiện, giống chống chịu mặn thể hiện ở cơ chế giảm khả năng quang hợp (GO: 0015979) và giảm sự tiền tổng hợp các chất sinh hóa hay năng lượng (GO: 0006091). Trong đó sự biểu hiện của gen OsTPP1 cho thấy phản ứng sớm của giống lúa Trà Lòng 2 khi có sự hiện diện của mặn. Kết quả này bước đầu đã chọn ra được các gen liên quan đến phản ứng stress mặn và có thể dùng tiếp cho nghiên cứu chuyên sâu hơn.

Abstract

In this study, Tra Long 2 variety was selected as salt tolerance genotype and Nep Mo represents as salt susceptible genotype. The experiment was carried out at 14 days old seedlings that were used to be treated with NaCl at 100 mM for 12 hours; after salt stress treatment, whole plants were collected; RNA was extracted and sequenced by using the Illumina Hiseq 2000 system. The results of transcriptome analysis indicated that 1732 uniquegenes were detected in Tra Long 2, while only 432 uniquegenes were found in Nep Mo. In comparison with the transcriptomes, the salt-tolerant variety showed down-regulated of photosynthesis (GO: 0015979), and generation of metabolites and energy (GO: 0006091). In which, the expression of OsTPP1 gene showed early response of Tra Long 2 variety under salt treatment. These results provide initial information of genes involved in the salinity stress response and can be used for further research.